Una de las tres fortalezas de Baracoa, Fuerte Matachín, se completó en 1802. En 1868 se convirtió en un puesto de guardia del ejército español para el reconocimiento y registro de todos los que entran y salen de la ciudad. Después de la instalación de la pseudo-República, se utilizó en primer lugar como un bastión contra los piratas y luego fue utilizado por los españoles como prisión. Hoy alberga el Museo Histórico Matachín, cuyas exhibiciones muestran la historia de la ciudad, incluidas sus raíces taínas. Hay ejemplos de cerámica taína, esculturas y otros artefactos; exhibiciones sobre ciudadanos famosos; y otras que explican el papel de la comunidad en las guerras por la independencia y la Revolución.

La tercera fortaleza de Baracoa, Fuerte de la Punta, se construyó en 1803 sobre la entrada de la bahía. Durante la pseudorepública, albergaba una oficina de radiotelegrafía. La fortaleza ahora contiene el Restaurante La Punta.

Una peculiar elevación de laderas verticales y cima plana localizada a 8 km de la ciudad de Baracoa, Colón la describió en el diario de su primer viaje a Cuba en 1492. El Yunque de Baracoa, declarado Monumento Nacional y símbolo de la ciudad de Baracoa, considerado una isla ecológica que llamó la atención del almirante Cristóbal Colón en su primer viaje a las Américas, sirviendo como un punto de orientación debido a sus características inusuales (su cima plana). La fauna del Yunque es rica y diversa, hay abundantes pájaros carpinteros, colibríes, jutias, lagartos, reptiles. Hay un mirador natural a 573 m, desde donde se puede ver un vasto paisaje de verdes montañas y ríos con la Bahía de Baracoa como telón de fondo.

La Catedral "Nuestra Señora de la Asunción", surge a principios del siglo XVI en el pueblo de Baracoa. En ese momento esta iglesia era conocida con el nombre de la Iglesia Parroquial de la Villa de Baracoa. La iglesia es mejor conocida por preservar la Cruz de la Parra que Colón supuestamente usó cuando desembarcó en 1492 para reclamar Cuba por España y el cristianismo. De hecho, la datación por carbono ha confirmado que la cruz se fabricó a fines del siglo XV y tiene la edad suficiente para haber sido llevada por el explorador. Se puede afirmar con certeza que esta es una de las cruces más antiguas (quizás la más antigua) en el Nuevo Mundo.